Trải qua những ngày nghỉ lãng mạn, Motoko và Batou không ngờ rằng họ sẽ bị cuốn vào một cuộc truy bắt nguy hiểm với tổ chức khủng bố có tên Scrasath. Trong khi đó, Togusa phải đối diện với vụ án mạng đầy bí ẩn, khi mà nạn nhân sở hữu một chiếc chân giả do Công ty Chân của Nàng tiên cá sản xuất. Liệu những bí mật đen tối nào sẽ được hé lộ khi họ tiến sâu vào cuộc chiến với thế lực đen tối không từ bất kỳ biện pháp nào để đạt được mục đích?