Trong một cuộc truy bắt tội phạm ác liệt, thanh tra Satou và Takagi đã phải đối diện với những tình huống nguy hiểm đến tột cùng. Trên con đường này, tình cờ một tên tội phạm, dưới cơn mê sảng, đã nhắc đến đảo Koumi - một hòn đảo huyền bí trên biển Thái Bình Dương. Koumijima không chỉ là một hòn đảo đẹp mắt, mà còn là nơi lưu trữ một truyền thuyết hấp dẫn về một ngôi nhà cổ bí ẩn nằm sâu dưới đáy biển - "Biệt thự dưới đáy biển". Một nguyên tắc kỳ lạ và ẩn chứa sự bí ẩn về hai nữ cướp biển danh tiếng, "Anne Bonney" và "Mary Read", người được cho là đã chôn giấu một kho báu vô giá từ hàng trăm năm trước. Nhưng khi Conan và đội thám tử nhí đến Koumijima nghỉ mát, họ không ngờ rằng họ sẽ đối mặt với những thử thách đầy nguy hiểm. Bọn săn lùng kho báu không ngừng theo đuổi, và một trong số họ đã gặp một cái kết đáng tiếc khi bị cá mập tấn công. Và điều gì kỳ lạ hơn, máu của cá lại được trét lên tượng đá cổ xưa, mở ra một bí mật khủng khiếp còn đang chờ đợi phía trước...